2030년 치바현 니가시오시.
만물상인 "오오타키 팩토리"의 아리카와 윤은
아무도 살지 않는 서양식 저택에 뭔가 있다고해 조사에 나선다.
공상 생물을 연구하는 대학원생 카미노 메이는
구 츠구노 지구 관리국 "미사키오쿠"에서 수신한 정체불명의 신호를 조사한다.
서로 전혀 다른 조사를 하며, 전혀 다른 장소를 찾은 두 사람은 각각의 장소에서 똑같은 노래를 듣는다.
그 노래는 두 사람을 이어, 세계를 휘말리게 하는 상상조차 못할 싸움으로 이끌게 된다.
고고한 연구자가 남긴 수수께끼, 각국에 출현하는 괴수들, 붉게 물들어가는 세계.
과연 두 사람은 인류에게 찾아온 거스를 수 없는 미래 <고질라>를 쓰러뜨릴 수 있는 것인가